Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Pkp1P97350 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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