Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
VdrP48281 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
VdrP48281 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
VdrP48281 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
VdrP48281 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
VdrP48281 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
VdrP48281 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
VdrP48281 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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