Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PdgfaP20033 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PdgfaP20033 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms