Protein–RNA interactions for Protein: F8VQJ0

Lce3e, Late cornified envelope 3E, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3eF8VQJ0 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm44481-201ENSMUST00000197288 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Lce3eF8VQJ0 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms