Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Ccdc6D3YZP9 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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