Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Spocd1B1ASB6 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms