Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm12075-201ENSMUST00000117426 397 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Speer3W4VSP1 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Speer3W4VSP1 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms