Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
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