Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
PtprtQ99M80 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
PtprtQ99M80 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms