Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Ube2q1Q7TSS2 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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