Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Mup1-203ENSMUST00000107499 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms