Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Trafd1Q3UDK1 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Trafd1Q3UDK1 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms