Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm14610-201ENSMUST00000118358 966 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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