Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 CT010575.2-201ENSMUST00000222876 496 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc13P50207 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc13P50207 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms