Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr20-201ENSMUST00000108465 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm7048-201ENSMUST00000199395 1891 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
VdrP48281 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
VdrP48281 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms