Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr1487-203ENSMUST00000209005 2061 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms