Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
H2-Eb1P04230 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms