Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms