Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm26486-201ENSMUST00000158021 110 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm6647-201ENSMUST00000170514 641 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm38142-201ENSMUST00000194093 3555 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Spocd1B1ASB6 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms