Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm46146-201ENSMUST00000217483 346 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps43-201ENSMUST00000173798 2473 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm3665-201ENSMUST00000177214 2461 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps51-201ENSMUST00000177271 2461 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Rabgef1Q9JM13 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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