Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Trim71Q1PSW8 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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