Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp46P62069 Gm11862-201ENSMUST00000119678 659 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms