Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpraP18052 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpraP18052 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PtpraP18052 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms