Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
H2-M1F7CXU4 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 264.5 ms