Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Gm340F6RGI3 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms