Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Ccdc6D3YZP9 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Ccdc6D3YZP9 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms