Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Vmn1r11-203ENSMUST00000228235 2376 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PtprbB2RU80 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PtprbB2RU80 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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