Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Grik3B1AS29 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms