Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5114W4VSN8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5114W4VSN8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms