Protein–RNA interactions for Protein: S4R185

Gm26938, Predicted gene, 26938 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26938S4R185 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm26938S4R185 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm26938S4R185 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm26938S4R185 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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