Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rspo1Q9Z132 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rspo1Q9Z132 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms