Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Cldn13Q9Z0S4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Cldn13Q9Z0S4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Cldn13Q9Z0S4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Cldn13Q9Z0S4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cldn13Q9Z0S4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cldn13Q9Z0S4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn13Q9Z0S4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn13Q9Z0S4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn13Q9Z0S4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn13Q9Z0S4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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