Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itsn1Q9Z0R4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itsn1Q9Z0R4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itsn1Q9Z0R4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Itsn1Q9Z0R4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms