Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F7

Sncg, Gamma-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncgQ9Z0F7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncgQ9Z0F7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncgQ9Z0F7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncgQ9Z0F7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SncgQ9Z0F7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncgQ9Z0F7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncgQ9Z0F7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncgQ9Z0F7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SncgQ9Z0F7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SncgQ9Z0F7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SncgQ9Z0F7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms