Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apobec2Q9WV35 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec2Q9WV35 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms