Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Scnn1bQ9WU38 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scnn1bQ9WU38 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms