Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MthfrQ9WU20 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MthfrQ9WU20 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms