Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkraQ9WTX2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkraQ9WTX2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms