Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trpc2Q9R244 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpc2Q9R244 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms