Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gabrg1Q9R0Y8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gabrg1Q9R0Y8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms