Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zeb2Q9R0G7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zeb2Q9R0G7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms