Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Wdr54Q9R0D8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Wdr54Q9R0D8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms