Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lamc3Q9R0B6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lamc3Q9R0B6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lamc3Q9R0B6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms