Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Six6Q9QZ28 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Six6Q9QZ28 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Six6Q9QZ28 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms