Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ23

Nfu1, NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfu1Q9QZ23 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nfu1Q9QZ23 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nfu1Q9QZ23 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nfu1Q9QZ23 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nfu1Q9QZ23 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nfu1Q9QZ23 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nfu1Q9QZ23 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nfu1Q9QZ23 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nfu1Q9QZ23 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nfu1Q9QZ23 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nfu1Q9QZ23 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nfu1Q9QZ23 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms