Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hacd1Q9QY80 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hacd1Q9QY80 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms