Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VapbQ9QY76 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VapbQ9QY76 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms