Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Opn4Q9QXZ9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Opn4Q9QXZ9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms