Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Limd1Q9QXD8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Limd1Q9QXD8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms