Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc4apQ9JLV2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trpc4apQ9JLV2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms